António Afonso é Professor Aposentado do ICBAS-UP e tem sido consultor para o Banco Mundial para o Desenvolvimento, no âmbito de projetos de desenvolvimento da aquacultura. Foi Professor Associado do (ICBAS-UP) no Departamento de Produção Aquática. Obteve Licenciatura em Ciências Aquáticas e realizou Doutoramento em Ciências Biomédicas (Imunologia de Peixes).

Foi Chefe do Laboratório de Imunobiologia do Grupo NUTRIMU do CIIMAR e PI/membro de equipas de projetos de investigação nacionais e europeus, incluindo projetos aplicados em parceria com empresas privadas de aquacultura. É Autor de inúmeros artigos internacionais, vários capítulos de livros e de centenas de apresentações e conferências em congressos.